1、倒置顯微鏡自由度大于正置顯微鏡
正置顯微鏡的試樣大小限制在平均高度80 mm和重量3kg，該范圍取決于所用的物鏡。倒置顯微鏡沒有這種限制。因為光學元件被放置在工作臺下部，而試樣則放置在物鏡上方。這表明用戶的工作距離更大，并可使用重達30kg大而沉重的試樣。因此，如果使用大而沉重或者尺寸和重量差別很大的試樣，倒置顯微鏡能夠提供您需要的自由度，顯微鏡下的世界更豐富。
2、倒置顯微鏡使您可以在較短時間內觀察更多試樣
采用倒置顯微鏡，您只需將試樣放置在工作臺上，聚焦到表面一次并使其成像便可完成工作。試樣在所有放大倍率下都能保持聚焦，且更多相同種類的試樣也同樣可以聚焦。采用正置顯微鏡，工作流程包含多個需要操作員執行的不同任務：切換到較小放大倍率進行定位時，需要依次降低工作臺、移出工作臺、取出試樣架、采用新試樣架、將試樣放置在試樣架上、保護試樣并使用壓片裝置平整試樣表面。操作員需要執行所有以上步驟，而且所有這些不同的步驟每次都伴有執行失敗的風險。對于未經培訓的操作員，放置試樣可能是一個艱巨任務；而采用倒置顯微鏡，將試樣放置在工作臺則輕而易舉，所需執行的步驟也更少，總體而言，倒置顯微鏡的使用方法更加簡便。另一點就是：所述正置顯微鏡的所有步驟加起來需要花費更多時間，尤其是在您需要依次觀察多個試樣時。我們假設操作正置顯微鏡是有豐富經驗的用戶，即使每個步驟只需5秒鐘，倒置顯微鏡用戶也能擊敗其同事。
3、正置顯微鏡與倒置顯微鏡工作流程比較
根據以上假設，比起在正置顯微鏡上分析試樣，倒置顯微鏡切換試樣的速度要快上4倍，因此利用倒置顯微鏡可以實現更高的生產效率。
4、采用倒置顯微鏡，不會導致物鏡撞壞試樣
好的操作員也可能遇到物鏡撞壞試樣的情況，這是使用正置顯微鏡時人人皆知的風險。發生這種情況時，您不僅需要投資購買新的物鏡，還需要丟棄試樣。在大多數情況下，沒有多余的物鏡可以立即使用，需要重新訂購。這便導致了試樣工作效率降低，并且如果沒有第二個顯微鏡可用，那么在壞情況下可能工作都要中斷。倒置顯微鏡的設計非常有助于降低物鏡撞壞試樣的風險。首先，物鏡位于工作臺下方，因此可以獲得更好的保護。其次，倒置顯微鏡具有上聚焦停止功能，該功能可通過定義管口上限來提供額外的安全性。因此，在保護投資的同時，您可以專注于自己的任務，而不用花時間擔心可能損壞工具和試樣。
5、倒置顯微鏡節省制備試樣的時間和金錢
因為照現在的情形采樣并將其放置在工作臺上，試樣制備將受到限制。另外，只有試樣的一側需要處理，當試樣不需要嵌入時，也就無需將更大的試樣切成幾個部分，與正置顯微鏡相比，倒置顯微鏡可以為您節省更多的時間。在顯微鏡上處理試樣時，也無需使用壓片裝置平衡試樣。您制備試樣只需執行兩個步驟，而不是七個。這可以節省您的時間和金錢。
6、倒置顯微鏡的操作方向和普通習慣一樣
如果用正置顯微鏡觀察試樣，根據正置顯微鏡的原理，您的大腦會遇到一個棘手的問題：向左移動工作臺時，您通過目鏡看到的試樣圖像是向右移動的。當然，反之亦然。
7、如果用倒置顯微鏡觀察試樣，試樣圖像與工作臺會朝著相同方向移動。這種運動方式符合我們對于運動的常規習慣。尤其對于未經培訓的用戶，倒置顯微鏡的使用方法從真正意義上減輕了工作，因為他們不必考慮試樣移動的方向，只需要像未通過光學元件一樣操作。做事情時不用思考可以節省時間，由此可以加快您的工作進程。
