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團隊實現(xiàn)?ngstr?m分辨率熒光顯微鏡

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西塘少主

北京內(nèi)容評審官

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RESI能夠以?ngstr?m分辨率跨長度尺度進行顯微鏡觀察:從單個蛋白質(zhì)的整個細胞到DNA中兩個相鄰堿基之間的距離。學(xué)分:馬克斯·伊格萊西亞斯

馬克斯普朗克生物化學(xué)研究所(MPIB)和慕尼黑路德維希-馬克西米利安大學(xué)(LMU)的Ralf Jungmann研究小組在熒光顯微鏡方面取得了突破。該團隊開發(fā)了順序成像分辨率增強(RESI),這是一項革命性的技術(shù),可將熒光顯微鏡的分辨率提高到?ngstr?m級。這項創(chuàng)新有望為我們研究生物系統(tǒng)的方法帶來范式轉(zhuǎn)變,迄今為止沒有的細節(jié)。

細胞是生命的基本單位,包含大量維持和延續(xù)生命系統(tǒng)的復(fù)雜結(jié)構(gòu)、過程和機制。許多細胞核心成分,如DNA、RNA、蛋白質(zhì)和脂質(zhì),只有幾納米的大小。這使得它們大大小于傳統(tǒng)光學(xué)顯微鏡的分辨率J限。因此,這些分子和結(jié)構(gòu)的確切組成和排列通常是未知的,導(dǎo)致對生物學(xué)基本方面缺乏機械理解。

近年來,超分辨率技術(shù)在分辨光的經(jīng)典衍射J限以下的許多亞細胞結(jié)構(gòu)方面取得了突飛猛進的進步。單分子定位顯微鏡(SMLM)是一種超分辨率方法,可以通過暫時分離其單個熒光發(fā)射來解析十納米大小的結(jié)構(gòu)。

當(dāng)單個目標在其他黑暗的視野中隨機點亮(它們閃爍)時,它們的位置可以用亞衍射精度確定。由Jungmann小組發(fā)明的DNA-PAINT是一種SMLM技術(shù),它使用染料標記的DNA“成像器”鏈與其靶標結(jié)合補體的瞬時雜交,以實現(xiàn)超分辨率所需的閃爍。然而,迄今為止,即使是DNA-PAINT也無法解析*小的細胞結(jié)構(gòu)。

在目前發(fā)表在《自然》雜志上的研究中,由共同**作者Susanne Reinhardt,Luciano Masullo,Isabelle Baudrexel和Philipp Steen以及Jungmann領(lǐng)導(dǎo),該團隊在超分辨率顯微鏡中引入了一種新方法,該方法從根本上實現(xiàn)了“無限”的空間分辨率。

這項新技術(shù)稱為通過順序成像增強分辨率,簡稱RESI,利用DNA-PAINT通過獨特的DNA序列編碼目標身份的能力。通過標記相鄰的靶標,即使通過超分辨率顯微鏡也無法分辨,使用不同的DNA鏈,將額外的分化程度(條形碼)引入樣品中。通過對**個序列進行順序成像,然后對另一個序列(從而對目標序列)進行成像,現(xiàn)在可以明確地分離它們。

至關(guān)重要的是,當(dāng)它們按順序成像時,目標可以任意接近彼此,這是其他技術(shù)無法解決的問題。此外,RESI不需要專門的儀器,事實上,它可以使用任何標準的熒光顯微鏡進行應(yīng)用,使幾乎所有研究人員都可以輕松使用。

為了證明RESI在分辨率上的飛躍,該團隊為自己設(shè)定了解決生物系統(tǒng)中*小空間距離之一的挑戰(zhàn):沿著DNA雙螺旋的單個堿基之間的分離,間隔不到一納米。

通過設(shè)計DNA折紙納米結(jié)構(gòu),使其呈現(xiàn)單鏈DNA序列,這些序列從一個堿基對距離從雙螺旋突出,然后依次對這些單鏈進行成像,研究小組解決了相鄰堿基之間0.85納米(或8.5 ?ngstr?m)的距離,這是以前無法想象的壯舉。研究人員以1 ?ngstr?m或10億分之一米的精度完成了這些測量,強調(diào)了RESI方法沒有的功能。

重要的是,該技術(shù)是通用的,不**于DNA納米結(jié)構(gòu)的應(yīng)用。為此,研究小組研究了利妥昔單抗的分子作用模式,利妥昔單抗是一種抗CD20單克隆抗體,于1997年首次被批準用于治療CD20陽性血癌。然而,研究這些藥物分子對分子受體模式的影響已經(jīng)超出了傳統(tǒng)顯微鏡技術(shù)的空間分辨率能力。了解這些模式是否以及如何在健康和疾病以及治療中發(fā)生變化,不僅對基本機制研究很重要,而且對設(shè)計新的靶向疾病療法也很重要。

使用RESI,Jungmann和他的團隊能夠揭示未處理細胞中CD20受體作為二聚體的自然排列,并揭示CD20如何在藥物治療后重新排列成二聚體鏈。單蛋白水平的見解現(xiàn)在有助于闡明利妥昔單抗的分子作用模式。

由于RESI是在完整的完整細胞中進行的,因此該技術(shù)縮小了純結(jié)構(gòu)技術(shù)(如X射線晶體學(xué)或低溫電子顯微鏡)與傳統(tǒng)的低分辨率全細胞成像方法之間的差距。Jungmann和他的團隊堅信,“這種沒有的技術(shù)不僅對超分辨率,而且對整個生物學(xué)研究都是真正的游戲規(guī)則改變者。

更多信息:Susanne C. M. Reinhardt 等人,?ngstr?m 分辨率熒光顯微鏡,《自然》(2023 年)。DOI: 10.1038/s41586-023-05925-9

期刊信息:自然

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